Guia docente
DATOS IDENTIFICATIVOS 2015_16
Asignatura MANIPULACIÓN GENÉTICA DE MICROORGANISMOS Código 00206040
Enseñanza
GRADO EN BIOLOGÍA
Descriptores Cr.totales Tipo Curso Semestre
3 Optativa Cuarto Primero
Idioma
Castellano
Ingles
Prerrequisitos
Departamento BIOLOGIA MOLECULAR
Responsable
APARICIO FERNÁNDEZ , JESÚS MANUEL
Correo-e jmapaf@unileon.es
jagils@unileon.es
-
Profesores/as
APARICIO FERNÁNDEZ , JESÚS MANUEL
GIL SANTOS , JOSÉ ANTONIO
PEDRO LOPEZ , ANTONIO DE
Web http://
Descripción general La manipulacion genetica de microorganismos es una poderosa herramienta que permite mejorar su comportamiento industrial o producir nuevos compuestos de interes biotecnologico. Genetic manipulation of microorganisms is a powerful tool to improve their industrial performance and to produce new compounds of biotechnological interest.
Tribunales de Revisión
Tribunal titular
Cargo Departamento Profesor
Presidente BIOLOGIA MOLECULAR CASQUEIRO BLANCO , FRANCISCO JAVIER
Secretario BIOLOGIA MOLECULAR MATEOS DELGADO , LUIS MARIANO
Vocal BIOLOGIA MOLECULAR CASTRO GONZALEZ , JOSE MARIA
Tribunal suplente
Cargo Departamento Profesor
Presidente BIOLOGIA MOLECULAR RUBIO COQUE , JUAN JOSE
Secretario BIOLOGIA MOLECULAR POLANCO DE LA PUENTE , CARLOS
Vocal BIOLOGIA MOLECULAR GUTIERREZ MARTIN , SANTIAGO

Competencias
Código  
A9 206CMAT106 Conocer las principales enzimas utilizadas en manipulación genética (enzimas de restricción, ligasas, fosfatasas, ADN y ARN polimerasas, etc)
A11 206CMAT108 Conocer las principales tecnologías para introducción de ADN en células microbianas
A40 206CMAT134 Conocer los principales tecnologías para la manipulación genéticas de grupos bacterianos de interes: Escherichia coli y Bacillus subtilis, Streptomyces, corinebacterias y levaduras y hongos filamentosos.
A42 206CMAT136 Conocer y analizar las principales tecnologías para la expresión de un ADN recombinante y los factores que la afectan
A90 206CMAT18 Análisis de ADN en geles de agarosa
A139 206CMAT223 Introducción de un ADN en bacterias
A151 206CMAT234 Manipular enzimáticamente un ADN: digestión, ligación, amplificación, etc
A186 206CMAT267 Realizar un sencillo proceso de clonación en la bacteria Escherichia coli
A281 206CMAT76 Conocer el desarrollo de la tecnología del ADN recombinante
A296 206CMAT9 Aislar ADN plasmídico bacteriano
B3 206CT3 Bases físicas y químicas de los procesos biológicos. Aplicaciones
B6 206CT6 Desarrollo y aplicación de productos y procesos de microorganismos
B13 206CT13 Estructura y función de biomoléculas. Bioensayos y diagnósticos biológicos
B14 206CT14 Estructura y función de microorganismos y virus, aislamiento y cultivo
B21 206CT21 Material genético, estructura y organización. Manipulación, análisis y asesoramiento genético
B26 206CT26 Trabajar de forma adecuada en un laboratorio biológico. Protocolos y procedimientos.
B28 206CTT2 Análisis y síntesis
B29 206CTT3 Aprendizaje autónomo
B31 206CTT5 Comunicación oral y escrita en la lengua nativa
B33 206CTT7 Diseño de experimentos, obtener información e interpretación de los resultados
B34 206CTT8 Gestión de la información
B38 206CTT12 Razonamiento crítico
B40 206CTT14 Trabajo en equipo

Resultados de aprendizaje
Resultados Competencias
Adquirir conceptos claros sobre los procesos biológicos que pueden ser manipulados y la forma de hacerlo. A9
A11
A40
A42
A139
A151
B3
B6
B13
B14
B26
B28
B29
B33
B34
B38
B40
Dominar los conceptos y metodologías en Ingeniería Genética. A9
A11
A40
A42
A90
A139
A151
A186
A281
A296
B3
B6
B13
B28
B29
B33
B34
B38
B40
Conocer las principales técnicas para la introducción de DNA en células microbianas. A11
A139
B3
B13
B14
B26
B29
B33
B40
Conocer los mecanismos moleculares que controlan la expresión génica. A9
A42
B3
B6
B13
B21
B28
B29
B34
B38
Conocer los diferentes métodos para la clonación de genes. A9
A11
A40
A90
A139
A151
A186
A296
B3
B26
B33
B40
Dominar los métodos para la mutagénesis in vitro de genes clonados. A9
A40
A151
A296
B3
B13
B26
B29
B33
B34
B38
B40
Conocer diferentes estrategias para el análisis funcional de genes. A9
A11
A40
A90
A139
A151
A296
B3
B13
B14
B21
B28
B29
B31
B34
B38
Realizar un sencillo proceso de clonación en la bacteria Escherichia coli A90
A139
A151
A186
A281
A296
B3
B21
B26
B40

Contenidos
Bloque Tema
Enzimas y técnicas Tema 1.- Conceptos generales. Nucleasas. Funciones biológicas. Enzimas de restricción. Principales tipos de sistemas de restricción-modificación. Nomenclatura. Metilasas.

Tema 2.- Electroforesis en geles de agarosa. y poliacrilamida. Electroforesis en campo pulsado (PFGE). Recuperación de fragmentos de ADN. Southern, Northern y Western.

Tema 3.- Ligasas. Técnicas de ligación. Fosfatasa alcalina. DNA polimerasas. Otras enzimas de modificación de ácidos nucleicos.
Vectores Tema 4.- Vectores para la clonación de DNA exógeno. Introducción de DNA exógeno en bacterias. Transformación. Competencia natural. Competencia artificial. Electroporación. Transducción. Conjugación.
PCR y secuenciación Tema 5.- Reacción en cadena de la polimerasa (PCR). Diseño de “primers”. Aplicaciones en clonación de genes, retro-PCR, AFLPs, RAPDs. Mutagénesis por PCR.
Se impartirá en inglés:
Polymerase Chain reaction (PCR). Primer design. Cloning applications, reverse transcription-PCR, AFLPs, RAPDs. Mutagenesis by PCR

Tema 6.- Secuenciación de ADN: Método químico; Método enzimático; Sistemas automáticos; Secuenciación cíclica; Pirosecuenciación. Estrategias de secuenciación.
Se impartirá en inglés:
DNA sequencing: Chemical and enzymetic methods; Automatic systems; Cycle sequencing; Pyrosequencing. Sequencing strategies.
Clonación y expresión génica Tema 7.- Obtención de genotecas en Escherichia coli. Estrategias de rastreo y utilización de genotecas. (Virtual)

Tema 8.- Expresión de genes clonados en E. coli. Mecanismos de control. RNA polimerasa. Factores sigma. Promotores. Sitios de unión a ribosomas.
Análisis funcional de genes Tema 9.- Análisis funcional de genes: Estrategias de inactivación génica por recombinación homóloga.

Planificación
Metodologías  ::  Pruebas
  Horas en clase Horas fuera de clase Horas totales
Prácticas en laboratorios 10 2 12
 
Trabajos 0 10 10
Tutorías 0 4 4
 
Sesión Magistral 18 27 45
 
Pruebas objetivas de tipo test 2 2 4
 
(*)Los datos que aparecen en la tabla de planificación són de carácter orientativo, considerando la heterogeneidad de los alumnos

Metodologí­as
Metodologías   ::  
  descripción
Prácticas en laboratorios Las sesiones prácticas implicarán el aislamiento de DNA plasmídico, digestiones de DNA, electroforesis en geles de agarosa, aislamiento de DNA a partir de geles de agarosa, ligaciones, transformación con ADN exógeno. Para la identificación del gen de interés se utilizarán métodos genéticos, bioquímicos o de hibridación de ácidos nucleicos.
Trabajos Se realizará un trabajo monográfico sobre temas de interés
Tutorías Tradicionales: A demanda del alumno, y previa solicitud por e-mail. Virtuales: A demanda del alumno y a través de la Moodle de la asignatura.
Sesión Magistral Se combinará la clase magistral con el uso de presentaciones multimedia. Los temas 5 y 6 se impartirán en lengua inglesa.

Tutorías
 
Tutorías
descripción
Tradicionales: A demanda del alumno, y previa solicitud por e-mail.

Virtuales: A demanda del alumno y a traves de la Moodle de la asignatura.

Evaluación
  descripción calificación
Sesión Magistral Conocimiento y comprensión de la materia. Se realizará un examen final teórico que consistirá en un examen tipo test.

La asistencia a las clases de teoría “presenciales” es obligatoria para los alumnos que cursen la asignatura por primera vez. Se hará un control de asistencia, y se podrá rebajar la calificación del examen final hasta un 10% en caso de no asistencia.
60% de la nota final
Prácticas en laboratorios La asistencia a las clases de prácticas es obligatoria para los alumnos que cursen la asignatura por primera vez. Se hará un control de asistencia.

Se realizará un examen práctico escrito, con respuestas de elección múltiple. El examen se podrá realizar conjuntamente con el teórico. Se suspenderá la asignatura si no se obtiene más de un 4,0 en el examen práctico.
30% de la nota final
Trabajos Se tendrá en cuenta la estructura, calidad, fuentes bibliográficas empleadas, originalidad, uso correcto de terminología específica, claridad y corrección en la redacción.
El trabajo podrá ser presentado en inglés.
10% de la nota final
Otros Todas las pruebas de evaluación se regirán normativamente por el “Reglamento de Evaluación y Calificación del Aprendizaje de la ULE” (Aprobado por el Consejo de Gobierno de la ULE el 12-03-2010) y por el documento “Pautas de actuación en los supuestos de plagio, copia o fraude en exámenes o pruebas de evaluación” (Aprobado por la Comisión Permanente del Consejo de Gobierno de la ULE, el 29/01/2015). Concretamente, para todas las pruebas escritas de la asignatura, el alumno deberá ir provisto exclusivamente de bolígrafo (o similares) azul o negro.
 
Otros comentarios y segunda convocatoria

La segunda convocatoria se evaluará igual que la primera.


Fuentes de información
Acceso a la Lista de lecturas de la asignatura

Básica Benjamin Lewin, ed, Genes IX , McGraw Hill Educación, 2008
David Clark, Molecular Biology, Academic Press. Elsevier Inc., 2010
J. Sambrook, and D.W. Russel, eds, Molecular Cloning: A Laboratory Manual , Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2001

Complementaria


Recomendaciones


Asignaturas que se recomienda haber cursado previamente
GENÉTICA FUNDAMENTAL / 00206010
MICROBIOLOGÍA GENERAL / 00206016