Guia docente

DATOS IDENTIFICATIVOS

2012_13

Asignatura

TÉCNICAS DE GENÓMICA Y PROTEÓMICA

Código

00209116

Enseñanza

M.U.MET.INVES.EN BIOLOGIA FUNDA.Y BIOMEDICINA

Descriptores

Cr.totales

Tipo

Curso

Semestre

Optativa

Primer

Anual

Idioma

Castellano

Ingles

Prerrequisitos

Departamento

PRODUCCION ANIMAL

Responsable

MARQUÉS MARTÍNEZ , MARGARITA

Correo-e

mmarm@unileon.es
jmapaf@unileon.es
jjarrs@unileon.es
ybayg@unileon.es
maferg@unileon.es
pgarg@unileon.es
bgutg@unileon.es
cgpolp@unileon.es
arodg@unileon.es
lesaec@unileon.es
isanh@unileon.es
fvaqr@unileon.es
fjvenb@unileon.es

Profesores/as

APARICIO FERNÁNDEZ , JESÚS MANUEL

ARRANZ SANTOS , JUAN JOSÉ

BAYÓN GONZÁLEZ , YOLANDA

FERRERO GARCÍA , MIGUEL ÁNGEL

GARCÍA GARCÍA , PEDRO

GUTIÉRREZ GIL , BEATRIZ

MARQUÉS MARTÍNEZ , MARGARITA

POLANCO DE LA PUENTE , CARLOS GASPAR

RODRÍGUEZ GARCÍA , ANTONIO

SÁENZ DE MIERA CARNICER , LUIS ENRIQUE

SANTAMARTA HERNÁNDEZ , IRENE

VAQUERO RODRIGO , FRANCISCA

VENCES BENITO , FRANCISCO JAVIER

Web

http://

Descripción general

La secuenciación de los principales genomas de animales y plantas ha sido uno de los hechos más relevantes de los últimos años, abriendo una nueva etapa en la investigación biomédica. Mientras que la Genómica estudia la estructura, función y evolución del conjunto de la información genética de un organismo, analizando su potencial de expresión génica, la Proteómica permite especificar qué proteínas, y en qué niveles se expresan en los distintos tipos de células de ese organismo, y en las distintas situaciones fisiológicas. El objetivo de esta materia es proporcionar a los alumnos los conocimientos conceptuales y las habilidades prácticas necesarias para la comprensión y la utilización básica de estas dos disciplinas tan utilizadas en la investigación actual.

Tribunales de Revisión

Tribunal titular
Cargo	Departamento	Profesor

Tribunal suplente
Cargo	Departamento	Profesor

Competencias

Tipo A	Código	Competencias Específicas
	A10846	209CM10 Dominio de las metodologías de análisis genómicos y proteómicos, de la modificación genética de microorganismos, animales y plantas, de análisis e identificación de genes, especialmente los implicados en enfermedades
	A10855	209CM19 Habilidad para la recogida sistematizada, el análisis y la presentación de los resultados de ensayos realizados con estas metodologías
	A10858	209CM4 Competencia para formular y realizar estudios de investigación genómica, proteómica, de ingeniería y de análisis genético
	A10868	209CMAT12 Uso de manuales de laboratorio
	A10886	209CMAT29 Utilización de recursos informáticos para manejo de bases de datos de DNA y de secuencias proteícas para interpretación de resultados o solución de problemas
Tipo B	Código	Competencias Generales y Transversales
	B2079	209CT1 Demostrar poseer y comprender conocimientos que se basan en los típicamente asociados al primer ciclo y los amplían y mejoran, lo que les aporta una base o posibilidad para ser originales en el desarrollo y/o aplicación de ideas, a menudo en un contexto de investigación
	B2080	209CT2 Saber aplicar los conocimientos adquiridos y su capacidad de resolución de problemas en entornos nuevos o poco conocidos dentro de contextos más amplios ( o multidisciplinares) relacionados con su área de estudio
	B2081	209CT3 Ser capaces de integrar conocimientos y enfrentarse a la complejidad de formular juicios a partir de una información que, siendo incompleta o limitada, incluya reflexiones sobre las responsabilidades sociales y éticas vinculadas a la aplicación de sus conocimientos y juicios
	B2082	209CT4 Saber comunicar sus conclusiones, y los conocimienots y razones últimas que las sustentan, a públicos especializados y no especializados de un modo claro y sin ambigüedades
Tipo C	Código	Competencias Básicas
	C1	Que los estudiantes sepan aplicar los conocimientos adquiridos y su capacidad de resolución de problemas en entornos nuevos o poco conocidos dentro de contextos más amplios (o multidisciplinares) relacionados con su área de estudio.
	C2	Que los estudiantes sean capaces de integrar conocimientos y enfrentarse a la complejidad de formular juicios a partir de una información que, siendo incompleta o limitada, incluya reflexiones sobre las responsabilidades sociales y éticas vinculadas a la aplicación de sus conocimientos y juicios.
	C3	Que los estudiantes sepan comunicar sus conclusiones (y los conocimientos y razones últimas que las sustentan) a públicos especializados y no especializados de un modo claro y sin ambigüedades.
	C4	Que los estudiantes posean las habilidades de aprendizaje que les permitan continuar estudiando de un modo que habrá de ser en gran medida autodirigido o autónomo.

Resultados de aprendizaje

Resultados	Competencias
- Dominar la terminología básica de la materia y comprender los fundamentos de las principales técnicas de Genómica y Proteómica.	A10846	B2079	C4
- Aplicar de forma independiente protocolos básicos de secuenciación de DNA y electroforesis bidimensional de proteínas.	A10855 A10858 A10868	B2080	C1 C4
- Utilizar recursos informáticos para el trabajo con bases de datos de DNA y de secuencias proteicas.	A10855 A10858 A10886	B2080	C1 C4
- Interpretar y discutir los resultados obtenidos en los casos prácticos realizados	A10855	B2081 B2082	C2 C3

Contenidos

Bloque

Tema

1. Marcadores genómicos (plataformas de genotipado de alto rendimiento, aplicación al desarrollo de sistemas automatizados de identificación, diagnóstico, etc.).
2. Análisis de la expresión génica diferencial mediante la tecnología de microarrays.
3. Herramientas bioinformáticas de aplicación en genómica.
4. Fundamentos de genómica funcional y comparada.
5. Electroforesis bidimensional de proteínas.
6. Análisis de proteínas por espectrometría de masas (MALDI-TOF, huella peptídica, análisis de modificaciones post-traduccionales, etc.).
7. Etiquetado de proteínas. Microarrays de proteínas y anticuerpos.
8. Interactoma: estudio de interacciones proteicas.

Planificación

Metodologías :: Pruebas
	Horas en clase	Horas fuera de clase	Horas totales
Prácticas en laboratorios	35	52.5	87.5

Practicas a través de TIC en aulas informáticas	15	22.5	37.5
Trabajos	20	40	60

Sesión Magistral	20	20	40


(*)Los datos que aparecen en la tabla de planificación són de carácter orientativo, considerando la heterogeneidad de los alumnos

Metodologías

Metodologías ::

	descripción
Prácticas en laboratorios	Durante las clases prácticas en el laboratorio, se implicará a los estudiantes en los proyectos de los grupos que participan en la asignatura, de modo que se familiaricen con los procesos de investigación y adquieran las destrezas básicas para el trabajo experimental autónomo. Se incidirá en la importancia de la competencia técnica y científica para asegurar la consecución de resultados precisos y reproducibles, a partir de los cuales se puedan sacar conclusiones válidas.
Practicas a través de TIC en aulas informáticas	A los alumnos se les instruirá en el uso de recursos informáticos para que puedan buscar la información que necesiten. Igualmente, se les dará acceso a la utilización de los programas informáticos específicos para la realización de actividades.
Trabajos	En algunos temas, se desarrollarán trabajos dirigidos (individuales o en pequeños grupos), que los alumnos prepararán en horas no presenciales.
Sesión Magistral	Los alumnos recibirán información teórica de los fundamentos técnicos y de los protocolos de trabajo, aunque la docencia será, fundamentalmente, práctica, bajo la supervisión de los profesores de la materia. Las clases teóricas consistirán en una exposición de los temas por parte del profesor, utilizando los medios audiovisuales disponibles en el aula (presentaciones en formato Power Point, vídeos, etc.). El alumno tendrá acceso a la plataforma de docencia online Moodle, en la que podrá descargar información para su estudio y realizar las actividades propuestas.

Tutorías

Trabajos

Sesión Magistral

Practicas a través de TIC en aulas informáticas

descripción

Durante las tutorías, el alumno podrá plantear dudas o cualquier otro problema relacionado con los contenidos teóricos o prácticos del programa de la asignatura. El profesor orientará a los alumnos sobre su trabajo, evaluará su capacidad de aprendizaje autónomo, y promoverá el desarrollo de las competencias transversales.

Evaluación

	descripción	calificación
Prácticas en laboratorios	Se valorará el interés y la actividad del alumno en el laboratorio y su capacidad para interpretar y aplicar protocolos de forma independiente.	60% (conjuntamente con las prácticas en aulas de informática)
Trabajos	Se calificará la estructura, calidad, fuentes bibliográficas empleadas, claridad y corrección en la redacción y en la presentación, y la capacidad de expresión oral.	20%
Sesión Magistral	Se evaluará el conocimiento y comprensión de la materia, la correcta utilización de la terminología, así como claridad y precisión en la redacción.	20%
Practicas a través de TIC en aulas informáticas	Se evaluará el manejo de herramientas informáticas y la capacidad de interpretación y discusión de resultados	Se evaluará junto con las prácticas en laboratorios

Otros comentarios y segunda convocatoria

Fuentes de información

Acceso a la Lista de lecturas de la asignatura

Básica	PEVSNER, J., Bioinformatics and functional genomics, Willey-Blackwell, 2009 VLAHOU A. , Clinical Proteomics. Methods and Protocols , Springer, 2008 DUBITZKY W.; GRANZOW M. & BERRAR, D.P. , Fundamentals of data mining in Genomics and Proteomics, Springer, 2007 BENFEY PH.N. & PROTOPAPAS A.D. , Genomics, Pearson Prentice Hall, 2005 PRIMROSE S.B. & TWYMAN R.M. , Genomics: Applications in human biology, Willey, 2003 LESK A.M. , Introduction to genomics, Oxford University Press, 2007 RUVINSKY A.& MARSHALL GRAVES J.A., Mammalian genomics, CABI Publishing, O’CONNOR C.D. & HAMES B.D., Proteomics, Blackwell, 2007 WESTERMEIER R., NAVEN T. & HÖPKER H-R., Proteomics in practice: a guide to successful experimental design, Wiley-VCH, 2008

Complementaria

Recomendaciones

Asignaturas que se recomienda cursar simultáneamente

ANALISIS DE DATOS / 00209106

INGENIERÍA GENÉTICA / 00209114

Asignaturas que se recomienda haber cursado previamente

METOD.ESTUDIO ACIDOS NUCLEICOS / 00209103

MÉTODOS DE ESTUDIO DE PROTEÍNAS / 00209104