Guia docente

DATOS IDENTIFICATIVOS

2016_17

Asignatura

GENÓMICA Y PROTEÓMICA

Código

00212014

Enseñanza

M.U.INVEST.EN BIOLOGIA FUNDA.Y BIOMEDICINA

Descriptores

Cr.totales

Tipo

Curso

Semestre

Optativa

Primer

Anual

Idioma

Castellano

Ingles

Prerrequisitos

Departamento

PRODUCCION ANIMAL

Responsable

MARQUÉS MARTÍNEZ , MARGARITA

Correo-e

mmarm@unileon.es
jmapaf@unileon.es
jjarrs@unileon.es
ybayg@unileon.es
maferg@unileon.es
pgarg@unileon.es
bgutg@unileon.es
arodg@unileon.es
lesaec@unileon.es
isanh@unileon.es
-
cgpolp@unileon.es
fvaqr@unileon.es
fjvenb@unileon.es

Profesores/as

APARICIO FERNÁNDEZ , JESÚS MANUEL

ARRANZ SANTOS , JUAN JOSÉ

BAYÓN GONZÁLEZ , YOLANDA

FERRERO GARCÍA , MIGUEL ÁNGEL

GARCÍA GARCÍA , PEDRO

GUTIÉRREZ GIL , BEATRIZ

MARQUÉS MARTÍNEZ , MARGARITA

RODRÍGUEZ GARCÍA , ANTONIO

SÁENZ DE MIERA CARNICER , LUIS ENRIQUE

SANTAMARTA HERNÁNDEZ , IRENE

MARTIN LOPEZ , MARTA

POLANCO DE LA PUENTE , CARLOS GASPAR

VAQUERO RODRIGO , FRANCISCA

VENCES BENITO , FRANCISCO JAVIER

Web

http://www.unileon.es/estudiantes/estudiantes-master/oferta-titulaciones/mu-metodologia-investigacion-biologia-biomedicina/plan-estudios?id=0212014&curso=2013

Descripción general

Esta materia presenta una introducción a los fundamentos de la Genómica y la Proteómica, disciplinas clave para un amplio rango de áreas de investigación en las ciencias biológicas. La asignatura está diseñada para que los alumnos adquieran conocimientos y habilidades sobre las herramientas utilizadas por la Genómica y la Proteómica, utilizando enfoques prácticos y haciendo énfasis en el potencial de estas tecnologías.

Tribunales de Revisión

Tribunal titular
Cargo	Departamento	Profesor
Presidente	BIOLOGIA MOLECULAR	FERNANDEZ LOPEZ , ARSENIO
Secretario	BIOLOGIA MOLECULAR	GIL SANTOS , JOSE ANTONIO
Vocal	MEDICINA,CIRUGIA Y ANAT.VETERI	PEREZ GARCIA , CARLOS CESAR

Tribunal suplente
Cargo	Departamento	Profesor
Presidente	BIOLOGIA MOLECULAR	VILLENA CORTES , ALBERTO JOSE
Secretario	BIOLOGIA MOLECULAR	RUIZ SANCHEZ , MARIA LUISA
Vocal	MEDICINA,CIRUGIA Y ANAT.VETERI	DIEZ PRIETO , INMACULADA

Competencias

Tipo A	Código	Competencias Específicas
	A13046	212CE11 Capacidad para formular, reconocer y realizar estudios de investigación genómica, proteómica, de ingeniería genética y de análisis genético de microorganismos, animales y plantas.
	A13048	212CE3 Capacidad para plantear y realizar ensayos según los PNT ( Protocolos Normalizados de Trabajo) , para utilizar el equipamiento científico adecuado y para la identificación y cuantificación de moléculas biológicas.
Tipo B	Código	Competencias Generales y Transversales
	B2890	212CG1 Proporcionar una formación teórico-práctica de los fundamentos metodológicos de investigación básica y aplicada para el desarrollo de actividades de I+D+I en Biología Fundamental, Biomedicina y Veterinaria orientada a seguir estudios posteriores y al ejercicio profesional.
	B2892	212CG3 Aprender a buscar información, a seleccionarla,a reunir e interpretar datos relevantes sobre diferentes temas.
	B2893	212CG4 Conseguir habilidades en el planteamiento de experimentos, planificación del trabajo, uso racional de los medios y de los recursos, recogida y análisis de los datos, su registro fiel, análisis, presentación y defensa de los mismos.
	B2894	212CT1 Expresión oral y escrita
	B2895	212CT10 Trabajo en equipo
	B2896	212CT11 Adaptación a nuevas situaciones, iniciativa y espiritu emprendedor
	B2897	212CT12 Pensamiento crítitco
	B2898	212CT13 Mantener un compromiso ético
	B2899	212CT2 Solucion de problemas
	B2900	212CT3 Utilizar Internet como medio de comunicación y como fuente de información
	B2901	212CT4 Habilidad de comunicación
	B2902	212CT5 Organizar y planificar el trabajo
	B2903	212CT6 Tomar decisiones
	B2904	212CT7 Liderazgo
	B2905	212CT8 Capacidad de autoevaluación
	B2906	212CT9 Creatividad
Tipo C	Código	Competencias Básicas
	C1	Que los estudiantes sepan aplicar los conocimientos adquiridos y su capacidad de resolución de problemas en entornos nuevos o poco conocidos dentro de contextos más amplios (o multidisciplinares) relacionados con su área de estudio.
	C2	Que los estudiantes sean capaces de integrar conocimientos y enfrentarse a la complejidad de formular juicios a partir de una información que, siendo incompleta o limitada, incluya reflexiones sobre las responsabilidades sociales y éticas vinculadas a la aplicación de sus conocimientos y juicios.
	C3	Que los estudiantes sepan comunicar sus conclusiones (y los conocimientos y razones últimas que las sustentan) a públicos especializados y no especializados de un modo claro y sin ambigüedades.
	C4	Que los estudiantes posean las habilidades de aprendizaje que les permitan continuar estudiando de un modo que habrá de ser en gran medida autodirigido o autónomo.

Resultados de aprendizaje

Resultados	Competencias
- Comprender los fundamentos de las principales técnicas de Genómica y Proteómica y actualizar conocimientos de las nuevas metodologías en estas disciplinas.	A13046 A13048	B2890 B2892 B2893 B2894 B2895 B2896 B2897 B2898 B2899 B2900 B2901 B2902 B2903 B2904 B2905 B2906	C1 C2 C3 C4
- Aplicar de forma independiente protocolos básicos de secuenciación de DNA y electroforesis bidimensional de proteínas.	A13046 A13048	B2890 B2892 B2893 B2894 B2895 B2896 B2897 B2898 B2899 B2900 B2901 B2902 B2903 B2904 B2905 B2906	C1 C2 C3 C4
- Utilizar recursos informáticos para el trabajo con bases de datos de DNA y de secuencias proteicas.	A13046 A13048	B2890 B2892 B2893 B2894 B2895 B2896 B2897 B2898 B2899 B2900 B2901 B2902 B2903 B2904 B2905 B2906	C1 C2 C3 C4

Contenidos

Bloque

Tema

Bloque I.

1. Marcadores genómicos (plataformas de genotipado de alto rendimiento, aplicación al desarrollo de sistemas automatizados de identificación, diagnóstico, etc.).
2. Análisis de la expresión génica diferencial mediante la tecnología de microarrays y de RNAseq.
3. Epigenómica.
4. Herramientas bioinformáticas de aplicación en genómica.
5. Fundamentos de genómica funcional y comparada.
6. Electroforesis bidimensional de proteínas.
7. Análisis de proteínas por espectrometría de masas (MALDI-TOF, huella peptídica, análisis de modificaciones post-traduccionales, etc.).
8. Etiquetado de proteínas.

Planificación

Metodologías :: Pruebas
	Horas en clase	Horas fuera de clase	Horas totales
Prácticas en laboratorios	175	0	175

Tutorías	15	0	15
Presentaciones/exposiciones	6	0	6

Sesión Magistral	54	0	54


(*)Los datos que aparecen en la tabla de planificación són de carácter orientativo, considerando la heterogeneidad de los alumnos

Metodologías

Metodologías ::

	descripción
Prácticas en laboratorios	Ensayos experimentales, problemas o simulaciones informáticas. Los estudiantes realizarán o seguirán un protocolo experimental siguiendo las buenas prácticas de laboratorio y la guía de buenas prácticas de manipulación de microorganismos modificados genéticamente. En dichas sesiones se discutirán, por parte de los estudiantes y el profesor, los resultados obtenidos, analizando su importancia e interés. También se realizarán prácticas a través de TIC en aulas informáticas.
Tutorías	Tiempo que cada profesor tiene reservado para atender y resolver dudas de los alumnos.
Presentaciones/exposiciones	Análisis de artículos científicos relevantes sobre temas actuales relacionados con la materia. - Preparación de memorias escritas, exposiciones orales o seminarios sobre trabajo experimental o bibliográfico. - Realización de tareas autónomas online o en aula informática.
Sesión Magistral	Exposición o discusión de los contenidos de la materia.

Tutorías

Sesión Magistral

Prácticas en laboratorios

Presentaciones/exposiciones

descripción

Tutorías especializadas presenciales y online mediante plataformas educativas de apoyo.

Evaluación

	descripción	calificación
Sesión Magistral	Evaluación continua complementada con pruebas teórico-prácticas realizadas durante el curso en las que se evaluarán los contenidos de las sesiones teóricas.	Ponderación mínima: 30.0 Ponderación máxima: 100.0
Prácticas en laboratorios	Evaluación continua con valoración del trabajo diario en el laboratorio (participación, orden, limpieza, manipulación de equipamiento, material, muestras y animales, atención, interés y registro anotado de datos…). Se evaluará el manejo de herramientas informáticas y la capacidad de interpretación y discusión de los resultados.	Ponderación mínima: 30.0 Ponderación máxima: 100.0
Presentaciones/exposiciones	Evaluación de la estructura, calidad, fuentes bibliográficas empleadas, claridad y corrección en la redacción de la presentación, y la capacidad de expresión oral.	Ponderación mínima: 30.0 Ponderación máxima: 100.0

Otros comentarios y segunda convocatoria

Fuentes de información

Acceso a la Lista de lecturas de la asignatura

Básica
	BENFEY PH.N. & PROTOPAPAS A.D. (2005). Genomics. Pearson Prentice Hall. DUBITZKY W.; GRANZOW M. & BERRAR, D.P. (2007). Fundamentals of data mining in Genomics and Proteomics. Springer. LESK A.M. (2007). Introduction to genomics. Oxford University Press O’CONNOR C.D. & HAMES B.D. (2007). Proteomics. Blackwell. PEVSNER J (2009). Bioinformatics and functional genomics. Willey-Blackwell. PRIMROSE S.B. & TWYMAN R.M. (2003). Genomics: Applications in human biology. Wiley. RUVINSKY A.& MARSHALL GRAVES J.A. (2005). Mammalian genomics. CABI Publishing. VLAHOU A. (2008). Clinical Proteomics. Methods and Protocols Series: Methods in Molecular Biology, Vol. 428. Springer. WESTERMEIER R., NAVEN T. & HÖPKER H-R. (2008). Proteomics in practice: a guide to successful experimental design. Wiley-VCH.
Complementaria

Recomendaciones