Guia docente

DATOS IDENTIFICATIVOS

2022_23

Asignatura

GENÓMICA

Código

01745005

Enseñanza

1745 - Máster Universitario en Investigación en Biotecnología y Biomedicina

Descriptores

Cr.totales

Tipo

Curso

Semestre

Obligatoria

Primer

Segundo

Idioma

Prerrequisitos

Departamento

PRODUCCION ANIMAL

Responsable

GUTIÉRREZ GIL , BEATRIZ

Correo-e

bgutg@unileon.es
mmarm@unileon.es
jgutg@unileon.es
cgpolp@unileon.es
asuav@unileon.es

Profesores/as

GUTIÉRREZ GIL , BEATRIZ

MARQUÉS MARTÍNEZ , MARGARITA

GUTIERREZ GONZALEZ , JUAN JOSE

POLANCO DE LA PUENTE , CARLOS GASPAR

SUAREZ VEGA, AROA

Web

http://

Descripción general

Tribunales de Revisión

Tribunal titular
Cargo	Departamento	Profesor
Presidente	PRODUCCION ANIMAL	ARRANZ SANTOS , JUAN JOSE
Secretario	BIOLOGIA MOLECULAR	GARCIA GARCIA , PEDRO
Vocal	PRODUCCION ANIMAL	FUENTE CRESPO , L. FERNANDO DE LA

Tribunal suplente
Cargo	Departamento	Profesor
Presidente	PRODUCCION ANIMAL	BAYON GONZALEZ , YOLANDA
Secretario	BIOLOGIA MOLECULAR	SAENZ DE MIERA CARNICER , LUIS ENRIQUE
Vocal	BIOLOGIA MOLECULAR	GONZALEZ CORDERO , ANA ISABEL

Competencias

Tipo A	Código	Competencias Específicas
	A18950	1745CE11 Capacidad para formular, reconocer y realizar estudios de investigación genómica, proteómica, de ingeniería genética y de análisis genéticos avanzados en microorganismos, animales y plantas.
	A18951	1745CE12 Capacidad para desarrollar habilidades que permitan aplicar y optimizar herramientas bioinformáticas especializadas y conceptos computacionales avanzados que se utilizan en los estudios genómicos y transcriptómicos.
	A18954	1745CE3 Capacidad para utilizar recursos informáticos actualizados relacionados con el manejo de bases de datos, tanto bibliográficas como relativas a las moléculas biológicas y a las particularidades de sus métodos de análisis avanzados.
	A18955	1745CE4 Capacidad de utilización de los métodos matemáticos y estadísticos adecuados para el análisis de datos avanzado, así como su edición y presentación en documentos científicos.
Tipo B	Código	Competencias Generales y Transversales
	B5753	1745CT1 Expresión oral y escrita.
	B5754	1745CT2 Solución de problemas.
	B5755	1745CT3 Utilizar internet como medio de comunicación y como fuente de información.
	B5757	1745CT5 Organizar y planificar el trabajo.
	B5758	1745CT6 Toma de decisiones.
	B5761	1745CT9 Creatividad.
	B5762	1745CT10 Trabajo en equipo.
	B5764	1745CT12 Pensamiento crítico.
	B5765	1745CT13 Mantener un compromiso ético.
	B5766	1745CG1 Adquirir una formación teórico-práctica actualizada de la metodología aplicada para el desarrollo de actividades de I+D+I en Biología Fundamental, Biomedicina Biotecnología y Veterinaria orientada a seguir estudios de doctorado, a la investigación y al ejercicio profesional.
	B5767	1745CG2 Capacidad de buscar bibliografía, manuales y protocolos de actividades específicas, tanto en papel como internet, y de desarrollar el razonamiento crítico para seleccionarla teniendo en cuenta su aportación a la materia y para reunir e interpretar datos relevantes sobre diferentes temas.
	B5768	1745CG3 Conseguir habilidades en el planteamiento de experimentos aplicando el método científico , planificación del trabajo, uso racional de los medios y de los recursos, recogida y análisis de los datos, su registro fiel, análisis, presentación y defensa de los mismos ante tribunales especializados.
Tipo C	Código	Competencias Básicas
	C1	Que los estudiantes sepan aplicar los conocimientos adquiridos y su capacidad de resolución de problemas en entornos nuevos o poco conocidos dentro de contextos más amplios (o multidisciplinares) relacionados con su área de estudio.
	C2	Que los estudiantes sean capaces de integrar conocimientos y enfrentarse a la complejidad de formular juicios a partir de una información que, siendo incompleta o limitada, incluya reflexiones sobre las responsabilidades sociales y éticas vinculadas a la aplicación de sus conocimientos y juicios.
	C3	Que los estudiantes sepan comunicar sus conclusiones (y los conocimientos y razones últimas que las sustentan) a públicos especializados y no especializados de un modo claro y sin ambigüedades.
	C4	Que los estudiantes posean las habilidades de aprendizaje que les permitan continuar estudiando de un modo que habrá de ser en gran medida autodirigido o autónomo.
	C5	Poseer y comprender conocimientos que aporten una base u oportunidad de ser originales en el desarrollo y/o aplicación de ideas, a menudo en un contexto de investigación

Resultados de aprendizaje

Resultados	Competencias
Comprender los fundamentos de las principales metodologías de obtención masiva de datos genómicos.	A18954	B5753 B5757 B5764 B5765 B5766 B5767	C1 C2 C3 C4
Procesar e interpretar de forma independiente la información de las bases de datos biológicas sobre genomas.	A18950 A18951 A18954	B5753 B5754 B5755 B5757 B5758 B5761 B5764 B5766 B5767 B5768	C2 C3 C4
Estar familiarizado con los principales recursos bioinformáticos y métodos computacionales para analizar datos derivados de estudios genómicos en Biología Fundamental y Biomedicina.	A18951 A18954 A18955	B5754 B5755 B5758 B5762 B5766 B5767	C1 C2 C4 C5

Contenidos

Bloque	Tema
I. INTRODUCCIÓN	Tema 1. Introducción a la Genómica. Organización del genoma. Proyectos de secuenciación. Next generation sequencing. Databanks. Ensembl y otras bases de datos. Tema 2. Manejo de genomas con Galaxy. Ensemblado de novo. Búsqueda de mutaciones.
II: MARCADORES GENÉTICOS Y TÉCNICAS DE MAPEO GENÉTICO.	Tema 3. Marcadores genómicos. Plataformas de genotipado de alto rendimiento y principales aplicaciones. Tema 4. Bases del mapeo genético. Análisis de ligamiento. Análisis de asociación de genoma completo o GWAS. Tema 5. Análisis Post-GWAS.
III. FLUJO DE ANÁLISIS BIOINFORMÁTICO DE DATOS DE SECUENCIACIÓN GENÓMICA	Tema 6. Manipulación avanzada de secuencias de DNA obtenidos mediante secuenciación masiva paralela (NGS): Alineamientos, formatos y calidad de secuencias. Identificación de variantes a partir de datos de NGS.
IV. GENÓMICA FUNCIONAL	Tema 7. Introducción a la Epigenómica.

Planificación

Metodologías :: Pruebas
	Horas en clase	Horas fuera de clase	Horas totales
Practicas a través de TIC en aulas informáticas	20	30	50

Tutorías	2	3	5

Sesión Magistral	8	12	20


(*)Los datos que aparecen en la tabla de planificación són de carácter orientativo, considerando la heterogeneidad de los alumnos

Metodologías

Metodologías ::

	descripción
Practicas a través de TIC en aulas informáticas	Ensayos experimentales, problemas o simulaciones informáticas. Los estudiantes realizarán o seguirán un protocolo experimental siguiendo las buenas prácticas de laboratorio, la guía de buenas prácticas de manipulación de animales de experimentación y/o microorganismos manipulados genéticamente. En dichas sesiones se discutirán, por parte de los estudiantes y el profesor, los resultados obtenidos, analizando su importancia e interés.
Tutorías	Tutorías especializadas presenciales online mediante plataformas educativas de apoyo. Asistencia al alumno en Actividades autoformativas. - Análisis de artículos científicos relevantes sobre temas actuales relacionados con la materia. - Preparación de memorias escritas, exposiciones orales o seminarios sobre trabajo experimental o bibliográfico. - Realización de tareas autónomas online o en aula informática.
Sesión Magistral	Exposición o discusión de los contenidos de la materia.

Tutorías

descripción

Evaluación

	descripción	calificación
Otros	Asistencia y participación activa en todas las actividades formativas (presenciales y on-line). Manejo de herramientas bioinformáticas relacionadas con la asignatura y capacidad de interpretación y discusión de los resultados derivados de su utilización. Realización, presentación y defensa de trabajos.	100%

Otros comentarios y segunda convocatoria
Aquellos controles no superados en la evaluación continuadeberán ser superados en la segunda convocatoria ordinaria. Examen final de laasignatura. El sistema de calificaciones se ajustará a lo estipulado en el RD1125/2003. Ponderación máxima 70%.

Fuentes de información

Acceso a la Lista de lecturas de la asignatura

Básica	, Acceso a la Bibliografía Recomendada del Catálogo de la Biblioteca, , Arthur Lesk, Introduction to Genomics, Oxford University Press, Libro Sarah S. Richardson, Hallam Stevens, Postgenomics: Perspectives on Biology after the Genome, Duke University Press Books, Libro

Complementaria

Recomendaciones